Boc-2-chloro-L-beta-homophenylalanine นิยมใช้ในการสังเคราะห์เปปไทด์และโปรตีนในงานวิจัยทางเคมีและชีวเคมี โดยเฉพาะในการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนซึ่งต้องการโครงสร้างเฉพาะทางเคมี เนื่องจากกลุ่ม Boc (tert-butoxycarbonyl) ช่วยในการป้องกันกลุ่มฟังก์ชันบางอย่างในระหว่างกระบวนการสังเคราะห์ ทำให้สามารถควบคุมและปรับแต่งโครงสร้างได้อย่างแม่นยำ นอกจากนี้ยังใช้ในการศึกษากลไกทางชีววิทยาและการพัฒนายา โดยเฉพาะยาที่เกี่ยวข้องกับการควบคุมเอนไซม์หรือตัวรับสัญญาณในร่างกาย