Boc-Phe(3-CF3)-OH ถูกใช้หลักในการสังเคราะห์เปปไทด์เป็นหน่วยย่อยสำหรับนำ residue phenylalanine ที่มี trifluoromethyl เข้าสู่โซ่เปปไทด์ กลุ่ม trifluoromethyl เพิ่มความ hydrophobic และความเสถียรทางเมแทบอลิซึมของเปปไทด์ ทำให้มีคุณค่าต่อการค้นคว้าและพัฒนายา โดยเฉพาะในการสร้าง therapeutics ที่ 기반บนเปปไทด์, ยับยั้งเอนไซม์, และ probes สำหรับศึกษาการโต้ตอบโปรตีน-โปรตีน กลุ่มป้องกัน Boc รับประกันการ deprotect ที่เลือกได้ใน solid-phase peptide synthesis อนุญาตให้ควบคุมการประกอบโครงสร้างเปปไทด์ที่ซับซ้อนอย่างแม่นยำ การประยุกต์ใช้ยังถูกสำรวจในวิทยาศาสตร์วัสดุสำหรับออกแบบเปปไทด์ที่มีคุณสมบัติพิเศษสำหรับนาโนเทคโนโลยีและ biomaterials