Boc-D-Phe(2-Cl)-OH ถูกใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เปปไทด์ในฐานะอนุพันธ์กรดอะมิโนที่ได้รับการป้องกัน กลุ่ม Boc (tert-butoxycarbonyl) ทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกันสำหรับฟังก์ชันเอมีน เพื่อป้องกันปฏิกิริยาที่ไม่ต้องการระหว่างการประกอบโซ่เปปไทด์ ตัวแทนคลอรีนบนวงแหวนฟีนิลสามารถมีอิทธิพลต่อกิจกรรมทางชีวภาพและคุณสมบัติการจับของเปปไทด์ ทำให้มีคุณค่าต่อการพัฒนาเปปไทด์ชีวภาพและเภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะอย่างยิ่งมีประโยชน์ในการสังเคราะห์ยาที่มีฐานเปปไทด์ ตัวยับยั้งเอนไซม์ และลิแกนด์ตัวรับ ซึ่งสเตอรีโอเคมีเฉพาะและการดัดแปลงกลุ่มฟังก์ชันมีความสำคัญต่อกิจกรรม นอกจากนี้ การประยุกต์ใช้ยังขยายไปสู่การวิจัยในเคมียารักษาเพื่อออกแบบและปรับปรุงโครงสร้างเปปไทด์ที่มีความเสถียรและความจำเพาะที่เพิ่มขึ้น