(R)-N-Boc-Propargylglycine ถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์สารเคมีและชีวโมเลกุล โดยเฉพาะในกระบวนการสร้างเปปไทด์และโปรตีนที่มีโครงสร้างซับซ้อน เนื่องจากมีกลุ่มฟังก์ชันัลที่สามารถทำปฏิกิริยาได้หลากหลาย เช่น กลุ่มอัลไคน์ (alkyne) ที่สามารถใช้ในการทำปฏิกิริยา Click Chemistry ซึ่งเป็นเทคนิคสำคัญในการเชื่อมต่อโมเลกุลอย่างแม่นยำ นอกจากนี้ยังใช้ในการศึกษาปฏิกิริยาเคมีของกรดอะมิโนและพัฒนายาใหม่ ๆ โดยเฉพาะในด้านการออกแบบโมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ และการวิจัยทางเภสัชวิทยา