N-Boc-DL-Methionine ถูกใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เปปไทด์ในฐานะกลุ่มปกป้องสำหรับกรดอะมิโนเมไทโอนีน กลุ่ม Boc (tert-butoxycarbonyl) ช่วยปกป้องความเป็นฟังก์ชันของอะมีนในระหว่างกระบวนการสังเคราะห์ ป้องกันปฏิกิริยาไม่พึงประสงค์ สารประกอบนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสของแข็ง (SPPS) ซึ่งช่วยให้มั่นใจในการถอดกลุ่มปกป้องและการจับคู่ของกรดอะมิโนอย่างเลือกสรร นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการเตรียมเปปไทด์และโปรตีนที่ถูกดัดแปลงสำหรับการวิจัยในชีวเคมีและการพัฒนายาเภสัชกรรม ความเสถียรของมันภายใต้สภาวะปฏิกิริยาต่างๆ ทำให้เป็นตัวเลือกที่เชื่อถือได้ในการสร้างโครงสร้างเปปไทด์ที่ซับซ้อน