สารนี้ใช้ในการสังเคราะห์เปปไทด์และโปรตีน โดยเฉพาะในกระบวนการ solid-phase peptide synthesis (SPPS) ซึ่งเป็นเทคนิคที่นิยมใช้ในห้องปฏิบัติการทางเคมีและชีวเคมี กลุ่ม Fmoc (Fluorenylmethyloxycarbonyl) ทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกันสำหรับหมู่อะมิโน ในขณะที่หมู่ฟังก์ชันอื่นๆ สามารถทำปฏิกิริยาได้อย่างอิสระ หมู่อะมิโนแอลานีนที่ถูกดัดแปลงด้วยฟลูออรีนที่ตำแหน่ง 2 และ 6 ช่วยเพิ่มความเสถียรและความเฉพาะเจาะจงของเปปไทด์ที่สังเคราะห์ขึ้น สารนี้มักใช้ในการวิจัยทางเภสัชกรรมเพื่อพัฒนายาเปปไทด์และศึกษาปฏิกิริยาระหว่างโปรตีนกับสารอื่นๆ