ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในกระบวนการผลิตยาที่มีโครงสร้างเป็นเพปไทด์หรือสารยับยั้งเอนไซม์ นิยมใช้ในขั้นตอนการสร้างโครงสร้างไซคลิกหรือโครงสร้างที่มีความเฉพาะเจาะจงสูง เนื่องจากหมู่ tert-butoxycarbonyl (Boc) ทำหน้าที่ป้องกันหมู่อะมิโนชั่วคราว ซึ่งสามารถถอดออกได้ภายหลังในสภาวะที่ควบคุมได้ ทำให้เหมาะสมกับการสังเคราะห์แบบขั้นตอนเดียวในระบบ solid-phase หรือ solution-phase นิยมใช้ในงานวิจัยด้านยาต้านไวรัส ยาต้านมะเร็ง และสารปรับภูมิคุ้มกัน