ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารประกอบทางเคมีที่ซับซ้อน โดยเฉพาะในงานวิจัยและพัฒนายา เนื่องจากมีหมู่ Boc (tert-butoxycarbonyl) ซึ่งทำหน้าที่เป็นหมู่ป้องกันหมู่อะมิโน ช่วยควบคุมการเกิดปฏิกิริยาเฉพาะจุดในโมเลกุลได้อย่างมีประสิทธิภาพ นอกจากนี้ โครงสร้างโมร์ฟอลีนและหมู่คาร์บอกซีมีผลต่อความสามารถในการละลายน้ำและคุณสมบัติของสารตั้งต้นในระบบชีวภาพ ทำให้เหมาะสำหรับใช้เป็นตัวกลางในการสร้างสารที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ เช่น สารยับยั้งเอนไซม์ หรือสารตั้งต้นของยาที่ต้องการความจำเพาะสูง