ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารประกอบเปปไทด์และสารที่มีโครงสร้างคล้ายเปปไทด์ โดยทำหน้าที่เป็นตัวตั้งต้น (building block) ในการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน โดยเฉพาะในงานวิจัยและพัฒนายาที่ต้องการความจำเพาะสูง เช่น ยาต้านมะเร็ง หรือยาที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาท กลุ่ม Boc (tert-butoxycarbonyl) ช่วยป้องกันหมู่อะมิโนระหว่างกระบวนการสังเคราะห์ ทำให้ควบคุมทิศทางของปฏิกิริยาได้ดี และสามารถกำจัดหมู่ป้องกันนี้ออกได้ภายหลังเมื่อต้องการ โดยโครงสร้างที่มีหมู่เมธอกซีฟีนิลช่วยเพิ่มความเข้ากันได้กับตัวทำละลายอินทรีย์ และช่วยปรับสมดุลระหว่างความเป็นขั้วและไม่เป็นขั้วในโมเลกุล ส่งผลต่อความสามารถในการซึมผ่านเยื่อหุ้มเซลล์ในชีวภาพ