Z-Trp-OBzl ถูกใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เปปไทด์ในฐานะตัวป้องกันสำหรับทริปโตเฟน (tryptophan) การประยุกต์ใช้ช่วยให้โซ่ข้างอินโดลของทริปโตเฟนคงตัวระหว่างขั้นตอนการจับคู่ (coupling) และการถอดป้องกัน (deprotection) ในการประกอบโซ่เปปไทด์ สารประกอบนี้มีประโยชน์เป็นพิเศษในการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสตะกอนแข็ง (SPPS) ซึ่งช่วยป้องกันปฏิกิริยาข้างเคียง ปรับปรุงผลผลิตและความบริสุทธิ์โดยรวมของเปปไทด์ที่สังเคราะห์ นอกจากนี้ Z-Trp-OBzl ยังถูกใช้ในการเตรียมเภสัชภัณฑ์ฐานเปปไทด์ที่ซับซ้อนและโมเลกุลชีวภาพ โดยการควบคุมการป้องกันกรดอะมิโนอย่างแม่นยำมีความสำคัญ ความคงตัวภายใต้สภาวะปฏิกิริยาต่างๆ ทำให้เป็นเครื่องมือที่มีคุณค่าสำหรับการวิจัยทางเคมีอินทรีย์และเคมียา