(S)-2-(Fmoc-amino)heptanoic acid ใช้หลักในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์แบบของแข็ง (solid-phase peptide synthesis, SPPS) โดยทำหน้าที่เป็นหน่วยสร้างหลัก (key building block) สำหรับการสร้างเปปไทด์ที่มีลำดับเฉพาะ กลุ่ม Fmoc (9-fluorenylmethoxycarbonyl) ทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกัน (protective group) สำหรับหมู่อะมิโน เพื่อให้เกิดปฏิกิริยาแบบเลือกสรร (selective reactivity) ในระหว่างกระบวนการสังเคราะห์ สารนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการผลิตเปปไทด์ที่ถูกดัดแปลงหรือเปปไทด์เลียนแบบ (peptidomimetics) โดยส่วนของกรดเฮปทาโนอิกสามารถนำเสนอคุณสมบัติโครงสร้างหรือหน้าที่ที่เป็นเอกลักษณ์ การประยุกต์ใช้ขยายไปสู่การค้นคว้าและพัฒนายา โดยช่วยในการสร้างยาที่มีฐานเปปไทด์ โมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ และเครื่องมือวิจัยสำหรับศึกษาการโต้ตอบของโปรตีนและเส้นทางชีวภาพ นอกจากนี้ ยังใช้ในการสังเคราะห์คอนจูเกตเปปไทด์สำหรับระบบการส่งยาแบบกำหนดเป้าหมายและโปรบวินิจฉัย