Fmoc-Cpa-OH เป็นสารประกอบที่ใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในฐานะหน่วยสร้าง (building block) สำหรับสร้างเปปไทด์ที่มีคุณสมบัติโครงสร้างเฉพาะ มักใช้ในเทคนิคการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสของแข็ง (solid-phase peptide synthesis: SPPS) เพื่อนำหน่วยไซโคลโพรพิลอะลานีน (cyclopropylalanine residues) เข้าสู่สายเปปไทด์ ซึ่งช่วยเพิ่มความเสถียรและความแข็งตัวของโครงสร้างเชิงคอนฟอร์เมชัน กลุ่มปกป้อง Fmoc (fluorenylmethyloxycarbonyl) ช่วยให้สามารถกำจัดปกป้องได้อย่างเลือกเฉพาะในระหว่างกระบวนการสังเคราะห์ อนุญาตให้ควบคุมการประกอบเปปไทด์ได้อย่างแม่นยำ การนำไปใช้มีความสำคัญในการพัฒนาเปปไทด์ชีวภาพ ยา และเครื่องมือวิจัยสำหรับศึกษาการโต้ตอบและหน้าที่ของโปรตีน