SI-2 hydrochloride ใช้หลักในการวิจัยทางชีวเคมี โดยเฉพาะในการศึกษาการโต้ตอบระหว่างโปรตีนและเส้นทางสัญญาณในเซลล์ มีบทบาทเป็นตัวยับยั้งเป้าหมายโปรตีนเฉพาะ ทำให้มีคุณค่าในการทำความเข้าใจกลไกของโรค เช่น มะเร็ง นักวิจัยใช้เพื่อสำรวจผลกระทบจากการรบกวนน้ำตกสัญญาณบางประการ ซึ่งให้ข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับกลยุทธ์การรักษาที่เป็นไปได้ นอกจากนี้ ยังนำไปใช้ในการค้นพบยาเพื่อประเมินประสิทธิภาพของสารประกอบใหม่ที่เล็งเป้าไปยังเส้นทางที่คล้ายคลึงกัน การประยุกต์ใช้จำกัดอยู่ที่การตั้งค่าทดลองในห้องปฏิบัติการ ซึ่งช่วยในการพัฒนาการบำบัดที่กำหนดเป้าหมายและความก้าวหน้าของความรู้ทางชีววิทยาโมเลกุล