อิลาพราซอลใช้หลักในการรักษาโรคทางเดินอาหาร โดยเฉพาะโรคที่เกี่ยวข้องกับการผลิตกรดในกระเพาะอาหารมากเกินไป มักสั่งจ่ายสำหรับภาวะเช่น โรคกรดไหลย้อน (GERD), แผลในกระเพาะและลำไส้เล็ก (peptic ulcers) และกลุ่มอาการซอลลิงเกอร์-เอลลิสัน (Zollinger-Ellison syndrome) ยานี้ทำงานโดยยับยั้งโปรตอนปั๊มในเยื่อบุกระเพาะอาหาร ลดการหลั่งกรดอย่างมีประสิทธิภาพ และบรรเทาอาการเช่น แสบร้อนกลางอก กรดไหลย้อน และปวดท้อง นอกจากนี้ยังใช้ร่วมกับยาปฏิชีวนะในการรักษาการติดเชื้อเฮลิโคแบคเตอร์ ไพโลไร ซึ่งเป็นสาเหตุหลักของแผลในกระเพาะอาหาร อิลาพราซอลยังใช้ในการจัดการความเสียหายของเยื่อบุกระเพาะที่เกี่ยวข้องกับความเครียดในผู้ป่วยวิกฤติ ผลที่ยาวนานช่วยให้รับประทานวันละครั้ง เพิ่มการปฏิบัติตามการรักษาและความสะดวกของผู้ป่วย