3-Iodoamphetamine hydrochloride ถูกใช้ในการวิจัยทางวิทยาศาสตร์เพื่อศึกษาการทำงานของระบบประสาทและสารสื่อประสาทในสมอง โดยเฉพาะอย่างยิ่งในด้านของตัวรับเซโรโทนินและโดปามีน ซึ่งเกี่ยวข้องกับภาวะทางจิตเวชและพฤติกรรมต่างๆ นอกจากนี้ ยังมีการนำไปใช้ในการพัฒนายาและสารประกอบใหม่ๆ ที่อาจมีศักยภาพในการรักษาโรคทางระบบประสาท เช่น โรคซึมเศร้า โรคจิตเภท และโรคพาร์กินสัน อย่างไรก็ตาม การใช้สารนี้ต้องอยู่ภายใต้การควบคุมอย่างเคร่งครัดเนื่องจากอาจมีผลข้างเคียงและความเสี่ยงต่อสุขภาพหากใช้ไม่ถูกต้อง