5-Bromopyrazine-2-carboxamide ถูกใช้หลักๆ ในงานวิจัยเภสัชกรรม โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยาต่างๆ โดยเฉพาะยาที่มุ่งเป้าไปที่ความผิดปกติทางระบบประสาทและเมแทบอลิซึม โครงสร้างของมันมีคุณค่าในการพัฒนายับยั้งเอนไซม์ เช่น ไคเนส ซึ่งมีบทบาทในเส้นทางสัญญาณที่เกี่ยวข้องกับโรคเช่นมะเร็งและเบาหวาน นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในการสร้างสารประกอบใหม่สำหรับศึกษากระบวนการชีวเคมี ช่วยในการค้นพบตัวแทนบำบัดที่อาจเป็นไปได้ การประยุกต์ใช้ขยายไปถึงงานวิจัยเกษตรเคมี ที่ซึ่งมันมีส่วนช่วยในการพัฒนายาฆ่าแมลงและวัชอัพพืชใหม่