ใช้หลักๆ เป็นสารตั้งต้นในงานสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการพัฒนายาและสารเคมีเกษตร หมู่ไอโอดีนที่ตำแหน่ง 3 และ 6 ทำให้เหมาะสำหรับปฏิกิริยาครอสคัปพลิง เช่น Suzuki หรือ Heck reactions ซึ่งช่วยในการสร้างระบบเฮเทโรไซคลิกที่ซับซ้อน นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมโมเลกุลชีวภาพที่ต้องการแกนพิริดาซีนเพื่อกิจกรรมทางชีวภาพ และได้มีการสำรวจในการสังเคราะห์สารที่มีรังสีสำหรับการถ่ายภาพทางการแพทย์ เนื่องจากอะตอมไอโอดีนสามารถถูกแทนที่ด้วยไอโซโทปกัมมันตรังสีได้