6-Chloro-4-methoxypicolinaldehyde เป็นสารเคมีที่ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารอินทรีย์ โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมและเคมีเกษตร มักถูกนำมาใช้เป็นสารตั้งต้นหรือสารกลางในการผลิตยาหรือสารกำจัดศัตรูพืช เนื่องจากโครงสร้างของมันมีกลุ่มฟังก์ชันที่สามารถทำปฏิกิริยาได้หลากหลาย เช่น กลุ่มอัลดีไฮด์และกลุ่มเมทอกซี ซึ่งช่วยในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนหรือคาร์บอน-เฮเทอโรอะตอมได้อย่างมีประสิทธิภาพ นอกจากนี้ ยังอาจถูกใช้ในการวิจัยและพัฒนายาใหม่ๆ เพื่อศึกษาประสิทธิภาพและกลไกการออกฤทธิ์ของสารประกอบทางเคมี