6-Phenoxynicotinaldehyde ถูกนำมาใช้ในการสังเคราะห์สารเคมีที่มีความสำคัญทางเภสัชวิทยาและเกษตรกรรม โดยเฉพาะอย่างยิ่งในกระบวนการสร้างสารตั้งต้นสำหรับการผลิตยาและสารกำจัดศัตรูพืช นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยทางเคมีเพื่อพัฒนาสารใหม่ที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ เช่น สารต้านเชื้อแบคทีเรียหรือสารต้านอนุมูลอิสระ เนื่องจากโครงสร้างของมันมีความสามารถในการปรับเปลี่ยนและเกิดปฏิกิริยาเคมีได้หลากหลาย ทำให้เป็นสารที่มีศักยภาพในการประยุกต์ใช้ในอุตสาหกรรมต่างๆ