2-Chloro-5-iodo-4-methylpyridine ถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในด้านการสังเคราะห์สารเคมี โดยเฉพาะในกระบวนการสร้างโมเลกุลที่มีความซับซ้อนสำหรับการวิจัยและพัฒนายา สารนี้มักใช้เป็นสารตั้งต้นหรือสารกลางในการสร้างสารประกอบอื่น ๆ ที่มีศักยภาพทางเภสัชวิทยา เช่น ยาต้านมะเร็งหรือยาต้านจุลชีพ นอกจากนี้ ยังมีการนำไปใช้ในด้านเคมีอินทรีย์เพื่อศึกษาปฏิกิริยาและการเกิดพันธะเคมีระหว่างโมเลกุลต่าง ๆ ซึ่งช่วยในการพัฒนาวิธีการสังเคราะห์ใหม่ ๆ ที่มีประสิทธิภาพมากขึ้น