2-Bromo-6-fluoro-3-methylpyridine ใช้หลัก ๆ เป็นบล็อกก่อสร้างในกระบวนการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการพัฒนายาและสารเคมีเกษตร โครงสร้างที่ไม่เหมือนใครของมันช่วยให้ทำหน้าที่เป็นสารกลางในการผลิตโมเลกุลที่ซับซ้อนมากขึ้น มักมีส่วนช่วยในการสร้างส่วนผสมยาสำคัญ (APIs) ที่มีผลทางรักษาที่มีศักยภาพ การมีอะตอมโบรมีนและฟลูออรีนทั้งคู่ในโมเลกุลทำให้มันมีปฏิกิริยาสูง ช่วยให้สามารถปรับเปลี่ยนแบบเลือกได้ในระหว่างปฏิกิริยาเคมี สารประกอบนี้ยังถูกใช้ในการสังเคราะห์สารประกอบเฮเตอร์โรไซคลิก ซึ่งจำเป็นในกระบวนการค้นพบและพัฒนายา นอกจากนี้ ยังมีการประยุกต์ใช้ในวิทยาศาสตร์วัสดุ ที่สามารถรวมเข้าไปในการออกแบบวัสดุขั้นสูงที่มีคุณสมบัติเฉพาะ ความหลากหลายในการทำปฏิกิริยาเคมีทำให้เป็นส่วนประกอบที่มีค่าในกระบวนการวิจัยและอุตสาหกรรม