(5-Methylpyridin-2-yl)methanamine ถูกนำมาใช้หลัก ๆ ในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมในฐานะสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์ส่วนประกอบยาสำคัญต่าง ๆ (APIs) สารนี้มีบทบาทสำคัญในการพัฒนายาที่มุ่งเป้าไปยังความผิดปกติทางระบบประสาท รวมถึงยาที่ใช้รักษาอาการซึมเศร้า ความวิตกกังวล และภาวะอื่น ๆ ของระบบประสาทส่วนกลาง (CNS) นอกจากนี้ สารประกอบนี้ยังถูกนำไปใช้ในการสร้างสารประกอบที่มีศักยภาพในการต้านการอักเสบและยาแก้ปวด ทำให้มีคุณค่าในการวิจัยการจัดการความเจ็บปวด คุณสมบัติทางโครงสร้างของมันยังทำให้เป็นบล็อกก่อสร้างที่มีประโยชน์ในการสังเคราะห์อินทรีย์สำหรับการผลิตโมเลกุลที่ซับซ้อนในเคมียารักษา