3-Bromo-2-methoxypyridine ใช้กันอย่างแพร่หลายเป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยาและสารเคมีเกษตรต่างๆ โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถทำการฟังก์ชันนาไลเซชันเพิ่มเติมได้ ทำให้มีคุณค่าในการพัฒนาสารออกฤทธิ์ทางเภสัชกรรม (APIs) โดยเฉพาะอย่างยิ่งมีประโยชน์ในการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนผ่านปฏิกิริยาครอส-คัปปลิ้ง เช่น ปฏิกิริยา Suzuki หรือ Buchwald-Hartwig ซึ่งจำเป็นในกระบวนการค้นพบยา นอกจากนี้ ยังทำหน้าที่เป็นบล็อกก่อสร้างในการผลิตสารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าแมลง สนับสนุนการพัฒนาตัวแทนป้องกันพืช ความหลากหลายในการสังเคราะห์อินทรีย์ของมันยังขยายไปถึงการสร้างลิแกนด์สำหรับการเร่งปฏิกิริยาและการประยุกต์ใช้ในวิทยาศาสตร์วัสดุ