4-Bromo-2-chloro-6-methylpyridine ใช้เป็นสารตั้งต้นในกระบวนการสังเคราะห์สารเคมีต่าง ๆ โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมยาและเกษตรกรรม ในด้านยา สารนี้มักถูกนำไปใช้ในการสร้างโมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ เช่น ยาต้านจุลชีพหรือยาต้านไวรัส นอกจากนี้ ยังมีการนำไปใช้ในการพัฒนาสารกำจัดศัตรูพืชหรือสารเคมีป้องกันพืช โดยเป็นส่วนหนึ่งของกระบวนการสร้างสารออกฤทธิ์ที่สามารถควบคุมหรือกำจัดศัตรูพืชได้อย่างมีประสิทธิภาพ นอกจากนี้ ยังอาจใช้ในการวิจัยทางเคมีเพื่อศึกษาปฏิกิริยาและกลไกต่าง ๆ ที่เกี่ยวข้องกับการปรับเปลี่ยนโครงสร้างโมเลกุล