5-Bromo-6-methylpicolinonitrile ใช้หลักๆ ในงานวิจัยและพัฒนายา โดยทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์โมเลกุลชีวภาพต่างๆ โครงสร้างของมันมีคุณค่าอย่างยิ่งในการสร้างสารประกอบที่มีศักยภาพในการรักษา เช่น ยับยั้งเอนไซม์หรือตัวรับเฉพาะ นอกจากนี้ยังมีประโยชน์ในการวิจัยสารเคมีเกษตรสำหรับพัฒนายาฆ่าแมลงหรือวัชตัวใหม่ ความตอบสนองที่เป็นเอกลักษณ์ของสารนี้ยังทำให้เหมาะสำหรับใช้ในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการสร้างโครงสร้างเฮเตอร์โรไซคลิกที่ซับซ้อน การประยุกต์ใช้ส่วนใหญ่จำกัดอยู่ในห้องปฏิบัติการ ซึ่งช่วยส่งเสริมความก้าวหน้าด้านเคมียาและเคมีเกษตร