6-(Difluoromethyl)pyridin-3-amine hydrochloride เป็นสารเคมีที่ใช้ในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมเพื่อการสังเคราะห์ยาชนิดต่าง ๆ โดยเฉพาะอย่างยิ่งในกระบวนการพัฒนายาใหม่ที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ สารนี้มักถูกนำมาใช้เป็นสารตั้งต้นหรือ intermediate ในการสร้างโมเลกุลที่มีโครงสร้างซับซ้อน ซึ่งอาจมีคุณสมบัติในการต้านเชื้อแบคทีเรีย ต้านไวรัส หรือยับยั้งเอนไซม์บางชนิด นอกจากนี้ยังอาจถูกนำไปใช้ในการวิจัยทางเคมีเพื่อศึกษาปฏิกิริยาและกลไกการทำงานของสารในระดับโมเลกุลอีกด้วย