ใช้เป็นตัวกลางที่ได้รับการป้องกันในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะในงานวิจัยเภสัชกรรมที่มุ่งเป้าไปยังสารยับยั้งคินาสและสารออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง (CNS) กลุ่ม tert-butoxycarbonyl (Boc) ช่วยในการป้องกันไนโตรเจนของ pyrrolo[3,2-c]pyridine อย่างเลือกสรร ทำให้สามารถทำการฟังก์ชันนาไลเซชันที่ควบคุมได้ในตำแหน่งที่ทำปฏิกิริยาอื่นๆ ระหว่างการสังเคราะห์หลายขั้นตอน นิยมใช้ในการพัฒนาผู้สมัครยาสำหรับโรคมะเร็งและความผิดปกติทางระบบประสาท เนื่องจากโครงสร้างหลักมีคุณสมบัติการจับที่เหมาะสมและความเสถียรทางเมแทบอลิซึม นอกจากนี้ยังใช้ในเคมีแบบคอมบิเนตอรีสำหรับการสร้างห้องสมุดสารประกอบเพื่อระบุโครงสร้างนำใหม่