ใช้เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์เภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะในการพัฒนายาที่มีฐานไพรีดีนซึ่งมีกิจกรรมทางชีวภาพ ใช้ในการเตรียมสารประกอบเฮเทอโรไซคลิกสำหรับการใช้เป็นยาต้านไวรัสและยาต้านมะเร็ง นอกจากนี้ยังนำไปใช้ในงานวิจัยเกษตรเคมีเพื่อออกแบบยาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืชใหม่ เนื่องจากมีกลุ่มไฮดราซีนที่ทำปฏิกิริยาได้ง่าย ใช้ทั่วไปในการสังเคราะห์อินทรีย์เพื่อสร้างวงแหวนที่มีไนโตรเจนซับซ้อนผ่านปฏิกิริยาไซคลิเซชัน หน้าที่ของเมทอกซีและไฮดราซีนช่วยให้สามารถปรับเปลี่ยนโครงสร้างได้อย่างเลือกสรร ทำให้มีคุณค่าในเคมีทางการแพทย์สำหรับการศึกษาความสัมพันธ์ระหว่างโครงสร้างและกิจกรรม