ใช้เป็นสารกลางในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายาที่ขัดต่อ central nervous system disorders และ oncology. โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถทำการฟังก์ชันนาไลเซชันแบบเลือกเพศได้ ทำให้มีคุณค่าในการสร้างโมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อนผ่านปฏิกิริยาครอส-คัปเปลิง เช่น ปฏิกิริยาซูซูกิหรือเฮ็ค. ยังใช้ในอุตสาหกรรมเกษตรเคมีสำหรับการผลิตยาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืช เนื่องจากช่วยเพิ่มประสิทธิภาพทางชีวภาพ. นิยมใช้ในห้องปฏิบัติการวิจัยสำหรับการติดฉลากและการติดตามรังสีเมื่อปรับเปลี่ยนแบบไอโซโทป ช่วยในการศึกษาการเมแทบอลิซึมและการค้นพบยา. ใช้ในสังเคราะห์สารอินทรีย์ โดยเฉพาะในการสร้างสารประกอบที่มีโครงสร้างพิริดีนที่มีการแทนที่ด้วยหมู่เมทิลและไอโอดีน ซึ่งมีความสำคัญในอุตสาหกรรมยา ทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นหรือตัวกลางในการสร้างสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ เช่น ยาต้านจุลชีพ ยาต้านมะเร็ง หรือสารปรับการทำงานของเอนไซม์ เนื่องจากหมู่ไอโอดีนสามารถทำปฏิกิริยาแทนที่ได้ง่ายในปฏิกิริยาคอปเปอร์-คาเทลิซิส หรือแพลเลเดียม-คาเทลิซิส เช่น ปฏิกิริยาซูซูกิ หรือเฮ็ค ทำให้สามารถต่อเติมหมู่ฟังก์ชันอื่นๆ ได้อย่างหลากหลาย จึงนิยมใช้ในงานวิจัยและพัฒนายาใหม่ๆ