2,3,6-Tribromopyridine ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารเคมีอื่นๆ โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมยาและสารกำจัดศัตรูพืช เนื่องจากโครงสร้างที่มีโบรมีนสามอะตอมทำให้มันสามารถทำปฏิกิริยาได้หลากหลาย นอกจากนี้ยังใช้ในการวิจัยทางเคมีเพื่อพัฒนาสารประกอบใหม่ที่มีคุณสมบัติเฉพาะ เช่น สารต้านเชื้อแบคทีเรียหรือสารป้องกันการกัดกร่อน ในกระบวนการผลิตสารเคมีบางชนิด 2,3,6-Tribromopyridine ยังอาจถูกใช้เป็นตัวกลางในการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนมากขึ้นอีกด้วย