6-Mercaptonicotinonitrile ใช้เป็นสารตั้งต้นหลักในการสังเคราะห์อินทรีย์ สำหรับการผลิตยาและสารเคมีทางการเกษตร กลุ่มไทออลของมันช่วยให้ทำหน้าที่เป็นนิวคลีโอไฟล์ในปฏิกิริยาเคมีต่างๆ ส่งเสริมการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน นอกจากนี้ ยังใช้ในการพัฒนาสารยับยั้งการกัดกร่อน โดยความสามารถในการสร้างชั้นป้องกันบนพื้นผิวโลหะได้รับการชื่นชมอย่างสูง ในสาขาเคมีวัสดุ มันมีส่วนช่วยในการสังเคราะห์โพลิเมอร์และสารเคลือบ เพิ่มความทนทานและประสิทธิภาพ โครงสร้างที่เป็นเอกลักษณ์ยังทำให้เป็นผู้สมัครสำหรับการวิจัยในด้านอิเล็กทรอนิกส์อินทรีย์ โดยเฉพาะการพัฒนาวัสดุนำไฟฟ้า