2,4-Dichloro-6-(methoxy-d3)-ไพริดิน ใช้เป็นสารกลางในการสังเคราะห์สารเคมีเกษตรและเภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะในการพัฒนายาฆ่าหญ้าและยาฆ่าเชื้อรา กลุ่มเมทอกซีที่ถูก deuterated ช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึม ทำให้มีคุณค่าในการวิจัยที่เกี่ยวข้องกับการติดฉลากไอโซโทปสำหรับศึกษากลไกทางชีวเคมีและเมแทบอลิซึมของยา นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมอนุพันธ์ไพริดีนสำหรับการประยุกต์ใช้วัสดุศาสตร์ เช่น อิเล็กทรอนิกส์อินทรีย์และสารเคลือบ