5-Bromo-6-hydroxy-2-methylpyrimidin-4(1H)-one เป็นสารประกอบที่นำมาใช้หลัก ๆ ในสาขาการวิจัยและพัฒนายาเภสัชกรรม โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์โมเลกุลชีวภาพต่าง ๆ โดยเฉพาะอย่างยิ่งสารที่มุ่งเป้าไปยังการยับยั้งเอนไซม์ คุณสมบัติทางโครงสร้างของมันทำให้มีคุณค่าในการออกแบบสารประกอบที่โต้ตอบกับเส้นทางชีวภาพเฉพาะเจาะจง เช่น เส้นทางที่เกี่ยวข้องกับการอักเสบหรือมะเร็ง นอกจากนี้ ยังมีการสำรวจศักยภาพของมันในการสร้างตัวแทนต้านจุลินทรีย์ชนิดใหม่ โดยอาศัยแกนไพรีมีดีนเพื่อรบกวนการเจริญเติบโตของจุลินทรีย์ นักวิจัยยังศึกษาบทบาทของมันในการปรับเปลี่ยนอนุพันธ์กรดนิวคลีอิก ซึ่งสามารถนำไปประยุกต์ใช้ในการบำบัดรักษาไวรัสหรือการศึกษาทางพันธุกรรม ความยืดหยุ่นในการสังเคราะห์อินทรีย์ของมันยังขยายไปสู่การพัฒนาสารเคมีเกษตร โดยมีส่วนช่วยในการสร้างยาฆ่าแมลงหรือสารกำจัดวัชพืชชนิดใหม่