N-Boc-2-Amino-5-bromopyrimidine เป็นสารเคมีที่ใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์สารอินทรีย์ โดยเฉพาะในกระบวนการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน เช่น การสร้างสารตั้งต้นสำหรับการผลิตยาและสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ เนื่องจากมีกลุ่ม Boc (tert-butoxycarbonyl) ที่ทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกัน (protecting group) สำหรับหมู่อะมิโน ช่วยให้สามารถควบคุมปฏิกิริยาเคมีได้อย่างแม่นยำในขั้นตอนการสังเคราะห์ นอกจากนี้ หมู่โบรโมที่ตำแหน่ง 5 ของโครงสร้างไพริมิดีนยังช่วยให้สารนี้สามารถเกิดปฏิกิริยา cross-coupling ได้ เช่น ปฏิกิริยา Suzuki หรือ Buchwald-Hartwig ซึ่งเป็นขั้นตอนสำคัญในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนหรือคาร์บอน-ไนโตรเจนในโมเลกุลเป้าหมาย สารนี้มีบทบาทสำคัญในการสร้างสารประกอบจากไพริมิดีนที่มีศักยภาพในการต้านไวรัส ต้านมะเร็ง หรือต้านการอักเสบ นอกจากนี้ ยังมีการประยุกต์ใช้ในการวิจัยสารเคมีเกษตรสำหรับพัฒนาสารกำจัดวัชพืช ยาฆ่าเชื้อรา และยาฆ่าแมลง ในด้านวิทยาศาสตร์วัสดุ สารนี้มีส่วนช่วยในการสร้างวัสดุขั้นสูงที่มีคุณสมบัติทางอิเล็กทรอนิกส์หรือ光学เฉพาะ ดังนั้น สารนี้จึงมีบทบาทสำคัญในอุตสาหกรรมเภสัชกรรม เคมีอินทรีย์สังเคราะห์ และสาขาอื่นๆ