1-Methylpyrimidine-2,4,6(1H,3H,5H)-trione ใช้หลักๆ ในอุตสาหกรรมการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการผลิตยา โดยเฉพาะในการพัฒนาอนุพันธ์บาร์บิทูเรต นอกจากนี้ยังใช้ในการสร้างสารเคมีเกษตรบางชนิด ซึ่งช่วยในการปรุงสูตรยาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืช นอกจากนี้ยังมีการนำไปใช้ในห้องปฏิบัติการวิจัยเป็นส่วนประกอบพื้นฐานสำหรับการสังเคราะห์โมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อน เพื่อช่วยในการศึกษาปฏิกิริยาเคมีและโครงสร้างโมเลกุล บทบาทของมันในการผลิตสีย้อมและเม็ดสียังขยายการใช้งานในอุตสาหกรรมเคมี