ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมยา สำหรับพัฒนายาต้านจุลชีพ ยาต้านไวรัส และยาที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง สารนี้มีโครงสร้างที่เหมาะสมในการสร้างปฏิกิริยากับเป้าหมายทางชีวภาพ ทำให้เป็นส่วนสำคัญในกระบวนการพัฒนายาใหม่ นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยด้านเคมีอินทรีย์เพื่อสร้างอนุพันธ์ของไพริไมดีนที่มีคุณสมบัติพิเศษสำหรับการประยุกต์ใช้งานด้านชีววิทยาและเภสัชกรรม