ใช้ในอุตสาหกรรมการผลิตสารเคมีเฉพาะทาง โดยเฉพาะในการสังเคราะห์สารชีวภาพและยา สารนี้มีบทบาทเป็นตัวตั้งต้น (building block) ในการสร้างสารประกอบที่มีโครงสร้างพิริมิดีน ซึ่งมักพบในยาที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ เช่น ยาต้านจุลชีพ ยาต้านไวรัส หรือยาที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยด้านเคมีอินทรีย์เพื่อพัฒนาสารใหม่ที่มีคุณสมบัติพิเศษ โดยเฉพาะในโครงการค้นคว้ายาใหม่ (drug discovery) เนื่องจากหมู่ไตรฟลูโรมีทิลและอะมิโนช่วยเพิ่มความเสถียรและฤทธิ์ทางชีวภาพของโมเลกุล