ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายาต้านไวรัสและยาต้านมะเร็ง โครงสร้างของมันสนับสนุนการสร้างอนุภาคนูคลีโอไซด์อนุโลม์ ซึ่งสามารถรบกวนการจำลองแบบไวรัสหรือการเจริญเติบโตของเนื้องอก ยังใช้ในการเตรียมอนุพันธ์พิริมิดีนที่ถูกฟังก์ชันนัลไลซ์สำหรับการวิจัยในเคมีทางการแพทย์และการค้นพบยา หมู่อิโอดีนช่วยให้สามารถปรับเปลี่ยนเพิ่มเติมผ่านปฏิกิริยาครอส-คัปปลิ้ง ทำให้มีคุณค่ากในการสร้างโมเลกุลซับซ้อนสำหรับการประเมินทางชีวภาพ โครงสร้างที่มีหมู่อะมิโนและไอโอดีนยังช่วยให้ทำปฏิกิริยาต่อได้ง่าย เช่น การแทนที่นิวคลีโอไฟล์หรือการเชื่อมพันธะคาร์บอน-คาร์บอนผ่านปฏิกิริยาคอปเปอร์หรือแพลเลเดียม จึงนิยมใช้ในงานวิจัยด้านเคมีอินทรีย์และเคมีทางการแพทย์