ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนาตัวยับยั้ง kinase และยาต้านไวรัส โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถปรับเปลี่ยนได้อย่างเลือกสรรเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพยาและการดูดซึมทางชีวภาพ ใช้บ่อยในเคมียารักษาโรคเพื่อสร้างโครงสร้างพื้นฐาน pyrimidine ที่พบในโมเลกุลที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยเกษตรเคมีเพื่อออกแบบยาฆ่าแมลงใหม่ที่มีประสิทธิภาพดีขึ้นและมีผลกระทบต่อสิ่งแวดล้อมน้อยลง