ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะตัวยับยั้งคินาสและยาต้านไวรัส โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถทำการฟังก์ชันนาไลเซชันแบบเลือกเฉพาะ สร้างส่วนประกอบยาที่มีฤทธิ์สูง (APIs) นิยมใช้ในงานวิจัยสารเคมีเกษตรสำหรับออกแบบสารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าแมลง เนื่องจากความสามารถในการปรับเปลี่ยนกิจกรรมทางชีวภาพในสิ่งมีชีวิตเป้าหมาย นอกจากนี้ยังใช้ในวิทยาศาสตร์วัสดุสำหรับพัฒนาสารประกอบเฮเทอโรไซคลิกอุดมไนโตรเจนที่ใช้ในอุปกรณ์อิเล็กทรอนิกส์และโฟโตอิเล็กทรอนิกส์ ใช้ในสังเคราะห์สารประกอบที่มีโครงสร้างพิริมิดีน ซึ่งเป็นแกนสำคัญในยาหลายชนิด โดยเฉพาะยาต้านไวรัส ยาต้านมะเร็ง และยาที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง ทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้น (intermediate) ในการสร้างสารอนุพันธ์ที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ เช่น การแทนที่ของคลอรีนด้วยหมู่อะมิโนหรือหมู่เมอร์แคปโต เพื่อพัฒนาสารที่มีคุณสมบัติเป็นตัวยับยั้งเอนไซม์เฉพาะเจาะจง นิยมใช้ในงานวิจัยและพัฒนายาในห้องปฏิบัติการ