ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารประกอบที่เป็นสารตั้งต้นในการผลิตยาฆ่าเชื้อ ยาต้านไวรัส และสารกำจัดศัตรูพืช โดยเฉพาะในกลุ่มของยากลุ่มพิริมิดีนที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพสูง โครงสร้างของมันช่วยให้เกิดปฏิกิริยาต่อเนื่องกับสารอื่นเพื่อสร้างสารที่มีฤทธิ์เฉพาะเจาะจง โดยมักใช้ในขั้นตอนการสร้างสารกลาง (intermediate) ในการผลิตยาในอุตสาหกรรมยาเคมี นอกจากนี้ยังพบการประยุกต์ใช้ในงานวิจัยด้านเคมีอินทรีย์ โดยเฉพาะการพัฒนาสารใหม่ที่มีโครงสร้างพิริมิดีนเป็นแกนหลัก