ใช้ในสังเคราะห์สารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมยาและสารเคมีเกษตร ทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นหรือสารกลางในการผลิตยาต้านจุลชีพ ยาต้านไวรัส ยาที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง สารกำจัดวัชพืช และสารควบคุมการเจริญเติบโตของพืช นอกจากนี้ยังนำไปใช้ในงานวิจัยด้านเคมีอินทรีย์เพื่อสร้างอนุพันธ์ของไพริไมดีนที่มีคุณสมบัติพิเศษ เช่น ความสามารถในการจับกับเป้าหมายทางชีวภาพเฉพาะจุด ซึ่งมีศักยภาพในการพัฒนาเป็นสารออกฤทธิ์ใหม่ในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมและสารเคมีเกษตร เนื่องจากมีอะตอมคลอรีนที่ทำปฏิกิริยาได้ง่าย จึงเข้าร่วมในปฏิกิริยาการแทนที่นิวคลีโอไฟล์ได้ดี ช่วยในการสร้างโมเลกุลซับซ้อนในงานวิจัยและอุตสาหกรรม