ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการผลิตยาต้านไวรัสและยาต้านมะเร็ง โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถทำการฟังก์ชันนาไลเซชันแบบเลือกเฉพาะได้ ทำให้มีคุณค่าในการพัฒนานิวคลีโอไซด์อะนาล็อก นอกจากนี้ยังใช้ในอุตสาหกรรมเกษตรเคมีสำหรับการสร้างสารกำจัดวัชพืชและสารควบคุมการเจริญเติบโตของพืช เนื่องจากความสามารถในการรบกวนเส้นทางเมแทบอลิซึมในศัตรูพืชและวัชพืช นอกจากนี้ยังทำหน้าที่เป็นบล็อกก่อสร้างในการเตรียมสีย้อมและวัสดุฟังก์ชันนัล โดยที่พิริมิดีนที่ถูกฮาโลเจนเสริมความเสถียรและปฏิกิริยา