ใช้เป็นสารตั้งต้นหลักในการสังเคราะห์เภสัชภัณฑ์และสารเคมีเกษตร โดยเฉพาะในการพัฒนาสารประกอบฐานไพริมิดีนที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ หมู่ฮาโลเจนช่วยให้เกิดปฏิกิริยาครอส-คัปปลิ้งแบบเลือกเพศ มีคุณค่าในเคมีทางการแพทย์สำหรับการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน ยังใช้เป็นบล็อกก่อสร้างในการเตรียมฮีเทอโรไซเคิลที่ถูกปรับแต่งหน้าต่างสำหรับยับยั้งคินาสและสารต้านจุลชีพ นิยมใช้ในปฏิกิริยาเปลี่ยนหมู่ไอโอดีนเป็นพันธะคาร์บอน-คาร์บอนหรือคาร์บอน-ฮีเทอโรอะตอมผ่านตัวเร่งคอปเปอร์หรือแพลเลเดียม เช่น Suzuki coupling หรือ Ullmann reaction เพื่อสร้างโมเลกุลซับซ้อนสำหรับการพัฒนายาและสารเคมีเกษตรใหม่