ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในกระบวนการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายาต้านไวรัสและยาต้านมะเร็ง โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถปรับแต่งได้ง่าย ทำให้มีคุณค่าในเคมียารักษาโรคสำหรับการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนมากขึ้น มักใช้ในการเตรียมตัวยับยั้งคินาสและสารที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพอื่นๆ ที่มุ่งเป้าไปยังเส้นทางเอนไซม์เฉพาะ นอกจากนี้ยังใช้ในการวิจัยสารเคมีเกษตรเพื่อพัฒนายาป้องกันพืชใหม่ เนื่องจากความตอบสนองทางเคมีและความเข้ากันได้กับเส้นทางการสังเคราะห์ต่างๆ โดยเฉพาะสารที่มีโครงสร้างพิริมิดีน ซึ่งมีบทบาทสำคัญในยารักษาโรคต่างๆ เช่น ยาต้านไวรัส ยาต้านมะเร็ง และยารักษาโรคติดเชื้อ สามารถทำปฏิกิริยาต่อได้ทั้งที่หมู่เอสเทอร์และวงพิริมิดีน ทำให้มีความยืดหยุ่นในการสังเคราะห์สารใหม่ในห้องปฏิบัติการ