4-Chloro-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-5-carbonitrile เป็นสารเคมีที่ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในขั้นตอนการสร้างโมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ เช่น ยาต้านมะเร็งหรือยาต้านไวรัส เนื่องจากโครงสร้างของมันมีส่วนประกอบที่สามารถทำปฏิกิริยาได้หลากหลาย ทำให้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการพัฒนายาชนิดใหม่ นอกจากนี้ ยังอาจถูกนำไปใช้ในงานวิจัยทางเคมีเพื่อศึกษาปฏิกิริยาและการสร้างพันธะเคมีที่ซับซ้อนอีกด้วย