6-Bromo-2-chloro-4-methylquinoline ใช้หลักในการวิจัยทางเภสัชกรรม โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์โมเลกุลที่ออกฤทธิ์ทางชีวภาพต่างๆ มีคุณค่าอย่างยิ่งในการพัฒนายา therapeutic ที่มีศักยภาพ รวมถึงยาต้านมาลาเรียและยาต้านมะเร็ง เนื่องจากโครงสร้างแกน quinoline ซึ่งมีคุณสมบัติทางยาที่เป็นที่รู้จัก นอกจากนี้ ยังนำไปประยุกต์ใช้ในการสังเคราะห์อินทรีย์เพื่อสร้างสารประกอบ heterocyclic ที่ซับซ้อน ซึ่งมักใช้ในกระบวนการค้นพบและพัฒนายา ส่วนย่อย bromo และ chloro ทำให้เป็นบล็อกก่อสร้างที่หลากหลายสำหรับการปรับแต่งเพิ่มเติมในเคมียา