ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายาต้านมาลาเรีย โครงสร้างของมันช่วยในการสร้างสารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพต่อสปีชีส์ Plasmodium ยังถูกนำมาใช้ในการวิจัยเพื่อพัฒนายับยั้ง kinase ใหม่ เนื่องจากแกนควิโนลินมีความสัมพันธ์กับตำแหน่งยึดเกาะของเอนไซม์ แสดงศักยภาพในด้านเกษตรเคมีสำหรับสารป้องกันพืช โดยอาศัยความเสถียรและปฏิกิริยาของมัน ใช้อย่างแพร่หลายในเคมีเภสัชกรรมสำหรับการศึกษาความสัมพันธ์โครงสร้าง-ฤทธิ์ทางชีวภาพ (SAR) เพื่อปรับปรุงยาตัวสมัคร