5-Fluoroquinolin-3-amine ถูกนำไปใช้ในงานวิจัยทางเคมีและเภสัชวิทยาเพื่อพัฒนายาต้านจุลชีพและสารต้านมะเร็ง เนื่องจากโครงสร้างของมันมีศักยภาพในการยับยั้งการทำงานของเอนไซม์และโปรตีนที่เกี่ยวข้องกับการเจริญเติบโตของเซลล์มะเร็งและเชื้อจุลินทรีย์ นอกจากนี้ยังมีการศึกษาเพื่อนำไปใช้ในการสังเคราะห์สารประกอบใหม่ที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพสูง ซึ่งอาจนำไปสู่การพัฒนายาชนิดใหม่ในอนาคต