5-Chloroquinolin-3-amine ถูกนำมาใช้ในหลายด้านของอุตสาหกรรมเคมีและเภสัชกรรม เนื่องจากโครงสร้างที่มีทั้งกลุ่มคลอรีนและควิโนลิน ซึ่งทำให้มีศักยภาพในการออกฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการวิจัยและพัฒนายา สารนี้มักถูกศึกษาเพื่อใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบอื่นๆ ที่อาจมีฤทธิ์ต้านเชื้อแบคทีเรีย ต้านไวรัส หรือต้านมะเร็ง นอกจากนี้ยังมีการนำไปใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารเคมีเพื่อการวิจัยทางวิทยาศาสตร์ เช่น การพัฒนาสารเรืองแสงหรือสารตรวจวัดในห้องปฏิบัติการ